In Puzzle Beach moet je de leuke piraten helpen hun schatten te verdedigen tegen stelende monsters uit de diepten van de zee in ware Tower Defense stijl. Het spel behoort ook tot het 3 op een rij genre, maar wordt op een compleet nieuwe manier gespeeld. Voor elke zet krijg je een eenheid om op het bord te plaatsen - jij kiest waar. Als je drie identieke eenheden naast elkaar plaatst, smelten ze samen tot een nieuwe eenheid.
De eenheden kunnen gebouwen of verdedigingen zijn. Je kunt veel punten scoren door de gebouwen te bouwen, terwijl de verdedigingen belangrijk zijn om de monsters op afstand te houden. Je hebt ook piraten die je zowel hinderen als helpen. Ze vallen de monsters aan, maar ze lopen je ook in de weg, dus je kunt niet altijd bouwen waar je wilt.
Elke zet in Puzzle Beach heet een dag, en in één dag kun je één ding doen: je kunt een eenheid op het speelbord plaatsen. Welke eenheid je kunt plaatsen, wordt willekeurig bepaald, maar de kans op een bepaalde eenheid neemt toe naarmate er meer van hetzelfde type op het bord staan.
Als drie gelijksoortige eenheden naast elkaar worden geplaatst, smelten ze samen tot een eenheid van een hoger niveau en leveren ze punten op. Hoe hoger het niveau van de eenheden die je samenvoegt, hoe meer punten je krijgt.
Onderweg komen de monsters uit de zee boven het speelbord en trekken naar je schatten toe die altijd onderaan het bord liggen. Je moet ervoor zorgen dat de monsters langs je eenheden lopen die ze kunnen aanvallen, anders lopen ze weg met je schatten. Het spel eindigt als je geen schatten meer hebt.
Blokkeer het pad van de zee naar de schat nooit helemaal, want dan wordt de reuzeninktvis boos! Hij zal uit de zee oprijzen en willekeurig je eenheden bombarderen tot er een nieuw pad is. Dat wil je meestal vermijden!
Aan de linkerkant van het scherm kun je je volgende eenheid zien en je hebt de optie om maximaal vier eenheden op te slaan voor later gebruik. Er is ook de winkel in het spel waar je de diamanten die je onderweg wint, kunt gebruiken om nieuwe eenheden en speciale upgrades te kopen.
Als je per ongeluk een eenheid verkeerd plaatst, kun je dit ook ongedaan maken door op de knop linksonder te drukken.
Het spel is opgebouwd rond werelden en missies. In elk van de zeven werelden van het spel zijn er vijf missies. De eerste vier missies zijn een soort training, terwijl de laatste missie de echte uitdaging is waarbij je het tegen andere spelers opneemt om een hoge score neer te zetten. Je moet het steeds opnieuw spelen.
In de trainingsmissies kun je echter ook hoge scores neerzetten, bijvoorbeeld door ze snel of boven de vereiste score op te lossen. Het doel in een trainingsmissie kan bijvoorbeeld zijn om vier huizen te bouwen in 100 dagen of om 100.000 punten te scoren binnen 75 dagen.
Als je een missie hebt voltooid, krijg je een gouden, zilveren of bronzen ster, afhankelijk van hoe goed je het hebt gedaan.
Boven in het spel zie je een indicatie van welke missie je aan het spelen bent en hoe ver je bent gevorderd. Je kunt ook op Menu drukken om de missiebeschrijving te krijgen.
Het spel heeft zeven werelden, elk met kleine verschillen. Ze staan hier opgesomd:
Peaceful Ocean- De eerste wereld biedt wat kortere spellen.
Eastern Channel- Hier krijg je veel sterren, maar een iets kleiner bord.
Pirate Strait- Deze wereld heeft extra veel piraten.
Southern Sea- Je hebt minder schatkisten en het bord is erg klein.
Cannon Bay- Er is meer kans om verdedigingen te bouwen.
Captain's Seaway- Het bord is hier extra groot.
Golf van inktvissen- In deze laatste wereld zijn er veel inktvissen.
Hier is een overzicht van de verschillende eenheden in het spel:
Gebouwen- begint met een tent die zes keer geüpgraded kan worden:
Verdediging- begint met een ton die vier keer geüpgraded kan worden:
Piraten- begint met een dekjongen die drie keer geüpgraded kan worden:
Ster- deze kan elke andere eenheid vervangen.
Schop- hiermee kun je een eenheid oppakken en op een nieuwe locatie plaatsen.
Moersleutel- hiermee kun je andere eenheden repareren of een extra leven geven.
Bom- je kunt de bom boven een eenheid of monster laten ontploffen om deze te verwijderen.
In de winkel in het spel heb je de mogelijkheid om je diamanten te gebruiken om alle bovenstaande eenheden in beperkte hoeveelheden te kopen, evenals deze extra upgrades:
Opslaguitbreiding- in eerste instantie heb je één extra opslagsleuf, maar deze kan worden uitgebreid tot vier sleuven.
Vooruitziendheid- normaal kun je alleen de volgende eenheid zien, maar je kunt toegang kopen om de volgende drie te zien.
Schatten- als je schatten verliest, kun je nieuwe kopen in beperkte hoeveelheden.
Luchtaanvallen- als er te veel monsters op het bord zijn, kun je de bombardiers inschakelen.
In het spelmenu vind je een lijst met eretekens. Dit zijn speciale onderscheidingen die je kunt verdienen door veel of handig te spelen.
Een Bonus Spin krijg je door drie gouden krabben te verwijderen. Ze verschijnen willekeurig langs de weg in plaats van de gewone monsters.